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Identification précoce d'un hybride interspécifique oranger x mandarinier par les marqueurs moléculaire microsatellites (SSR)


Examen de rattrapage, Matière 2. Marqueurs moléculaires et Amélioration des Plantes. MODULE 'Biotechnologies et Amélioration des Plantes', Parcours S6 : 'Biologie Appliquée aux Productions Végétales', Juin 2017, durée : 75 minutes.
-----> Corrections brèves


QUESTION 1


Afin de connaitre la paternité d'un hybride naturel de Citrus dénommé localement Zhelong zhoupigan, Li et al. (2015, Scientia horticulturae 186, 24-30) ont analysé l'ADN nucléaire (nDNA) et l'ADN chloroplastique (cpDNA) de 20 espèces de Citrus et espèces apparentées par les marqueurs microsatellites nSSR et cpSSR, respectivement. Les fragments d'ADN amplifiés par PCR à l'aide des amorces CS-017 (pour nDNA) et CP2 (pour cpDNA), ont été séparés sur gel de polyacrylamide 6%.


 Hybride orangier x mandarinier

La dernière amorce a permis d'obtenir l'électrophorégramme ci-dessous.

Citrus reticulata x Citrus sinensis

L'utilisation de l'amorce CS-017 pour amplifier le nDNA a permis de regrouper l'hybride naurel inconnu avec Citrus reticulata (mandarinier).
1) Expliquer les raisons du choix du gel de polyacrylamide 6% comme support de séparation par éléctrophorèse des fragments d'ADN amplifiés par PCR. Quels autres supports peuvent être utilisés ans cette situation.
2) A l'aide d'un tableau, comparer les marqueurs moléculaires de type SSR et RAPD (étapes principales, enzymes utilisées, effet de l'environnement, reproductibilité, déterminisme de dominance-codominance).
3) En s'aidant de l'électrophorégramme, déduire la différence structurale susceptible d'expliquer la mobilité de l'ADN amplifié des plantes.
4) Quelles peuvent être les parents mâle et femelle de l'hybride naturel inconnu du Citrus. Justifier les réponses.


QUESTION 2


A l'aide d'un tableau, comparer brièvement les methodes de transfert d'un transgène selon les techniques de la transformation chimique, électroporation, biolistique et via Agrobacterium tumefaciens (Type d'agent de transfert et exigences techniques)


CORRECTIONS BREVES.....




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Palmier dattier. Electrophorèse des isoenzymes, Biosys