Les informations obtenues au niveau phénotypique sont souvent difficiles à interpréter, car, il s'agit de variations continues où de nombreux gènes peuvent y être impliqués. Les marqueurs génétiques de types protéique, enzymatique ou nucléiques, dont l'expression est indépendante de l'environnement peuvent être utilisés pour caractériser les populations et évaluer leur diversité génétique aux niveaux intra- et inter-populations.
Un marqueur biochimique et moléculaire est une protéine ou une séquence de DNA facilement détectable et transmissible génétiquement. Il résulte d'un polymorphisme pouvant être utilisé dans l'étude de la diversité génétique.
Historique de l'utilisation des marqueurs
Différents types de polymorphismes
1/
Polymorphisme des protéines.
-
Polymorphisme des protéines de réserve.
- Polymorphisme enzymatique (isoenzymes).
2/
Polymorphisme du DNA (Acide désoxyribonucléique).
Les DNA nucléaire et cytoplasmique (DNA des chloroplastes (cpDNA) et le DNA mitochondrial (mtDNA)) peuvent être étudiés pour leur polymorphisme. Les cpDNA et mtDNA sont de taille plus faible par rapport à celle du DNA nucléaire. Cependant, ils existent sous forme de plusieurs copies dans une cellule et sont généralement transmis maternellement.
Polymorphisme
détecté par RFLP
Polymorphisme détecté par PCR
Polymorphisme détecté par RAPD
Polymorphisme détecté par AFLP
Polymorphisme détecté par d'autres techniques
Qualités
d'un bon marqueur.
-
Polymorphe.
- Transmis de façon codominante.
- Facile à obtenir.
- Reproductible.
Aucun marqueur ne possède toutes les qualités requises
Moyens de détection des marqueurs
L'électrophorèse est une méthode d'analyse et de séparation basée sur les critères de la chargeélectrique et la taille des molécules. La migration différentielle de particules chargées électriquement, se fait sous l'influence d'un champs électrique. Seules les particules chargées positivement ou négativement sont attirées par les pôles opposés du champs électrique. Les composés qui peuvent être transformés en particules chargées par formation de complexes, sont de même sujets à une migration sous l'effet du champs électrique.
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diversité génétique. Marqueurs